Malcolm est un jeune garçon au milieu d'une famille de foldingue : Reese, son grand frère débile, Dewey, son petit frère plus malin que mignon, Hal,un père totalement irresponsable et enfin Loïs une mère totalement hystérique. Mais le jour où Malcolm apprend qu'il a un QI de 165, tout change pour lui, il se voit transféré dans la classe des têtes d'ampoule rempli d'intello comme lui... Au fur et à mesure des saisons, Malcolm nous montrera son petit monde bien trippant et sa vie un tantinet étrange...